Věda a výzkum na FAPPZ odpovídá na nejnovější trendy v zemědělském výzkumu, který již není orientován pouze na klasická agrobiologická témata, ale i na témata jako jsou environmentální vědy, obecně biologická témata, bezpečnost a kvalita potravin, rozvoj venkova, krajinná a zahradní architektura či sociální zemědělství. Řada vědeckovýzkumných témat je řešena ve spolupráci s partnerskými výzkumnými ústavy, zejména s Výzkumným ústavem rostlinné výroby v Praze – Ruzyni, Výzkumným ústavem živočišné výroby v Praze – Uhříněvsi, Výzkumným ústavem meliorací a ochrany půd v Praze – Zbraslavi, Zemědělským výzkumným ústavem v Kroměříži, Výzkumným ústavem pícninářským v Troubsku, Výzkumným ústavem pro chov skotu v Rapotíně, pracovišti Akademie věd ČR a ostatními VŠ.
Hlavní směry výzkumu na FAPPZ
- Udržitelné využívání přírodních zdrojů a rozvoj venkovského prostoru
- Rostlinná produkce, zahradnictví, rostlinolékařství,
- Živočišná produkce, zájmové chovy, výživa zvířat
- Genetika, šlechtění a biotechnologie
- Kvalita a zpracování zemědělských produktů, výživa a potraviny
